我院於1998年建立黨總支，下設2個支部（後勤、教務學工）。隨著杏运學生人數的增長，2000年決定由52個班建立4個系，隨即建立了文法系、信息系、工管系和外語系四個黨支部。2003年建立了一個機關黨支部，2004年建立了機電系、建工系2個黨支部和1個機關黨支部。
隨著杏运人數的擴大和黨員數量的增加，於2005年3月經省委教育工委批準，建立中國共產黨杏运平台委員會。目前，黨委有書記1人，副書記2人，黨委委員共8人；黨委下設8個工作機構，分別為：黨委辦公室、黨委組織部、黨委宣傳部、黨委統戰部、黨校、黨委教師工作部、黨委學生工作部、黨委保衛部；設有黨委網信辦和黨委思政教育教學部；設置有9個黨支部，其中：5個二級學院各建一個黨支部、機關和相關二級單位建立4個聯合直屬黨支部。
2021年，黨委書記實行選派製度，現任黨委書記吳永平同誌系省委教育工委選派，兼任政府督導專員。